目前，我国有机肥生产企业大约有2000多家，大小不一，品种相当多。我国有机肥料生产企业的规模大致分为4个级别：普及型（小于0.5万t）占36%，小型（0.5万~2万t）占40%，中型（2万~10万t）占21%，大型（大于10万t）占3%。从全国范围来看，企业主要集中在两个大区域：一是经济发达地区，包括广东、浙江、江苏和福建等地。这些地区环保意识强，有优惠政策和相对成熟的技术作为支撑。二是有机肥资源丰富的地区，包括山东、河南、河北、广西等地区，企业主要分布在大中型畜禽养殖厂附近和有机特殊资源（食品加工、发酵等）地区等。
千讯咨询发布的中国有机肥市场前景调查分析报告显示，有机肥料生产企业在我国分布的区域性差异较大，分布在经济发达区和资源丰富区的有机肥料生产企业约占全国有机肥料生产企业的2/3，其中华东地区占比最大，为36.2%，其次是东北地区占20.2%，华中地区占18.6%，西南、华北、华南、西北地区分别占9.3%、7.5%、4.2%、4.0%。
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