1月23日召开的北京市审计工作会上，北京市审计局有关负责人表示，2009年北京市审计机关共审计和调查了823个单位，查出违规金额5.65亿元，损失浪费金额2.89亿元，直接为国家财政增收节支2.4亿元，挽回损失1.1亿元。
2009年本市不断深化预算执行审计。全年共审计和调查了157个预算单位，提出审计建议380条，被采纳274条，查出违规问题1257万元，损失浪费问题4199万元。
公共财政体制改革政策措施的落实情况，行政事业单位资产管理情况，税收和非税收入征管情况，财政性结余资金和事业收入预算安排使用的合理性，以及各部门压缩经常性项目支出、控制会议、差旅、接待、出国等费用情况等，均被列为审计关注的重点。其中，北京海淀区审计与税务部门联动，促进相关涉税单位补缴税费及滞纳金2.5亿元。
为进一步扩大审计覆盖面，市审计局在2009年组织未纳入预算执行审计范围的154个市级部门开展自查。此次自查共发现不规范金额25.1亿元，已有44个部门采取调账、补办手续、撤销账户、上交国库等形式，对存在的问题进行了纠正，纠正金额为2.2亿元。
2009年信贷规模急剧放大、风险增加，北京市审计局对部分地方金融机构有关经营状况进行了专项审计调查。审计调查涉及金融资产总额7056.55亿元，查出管理不规范问题141亿元。针对企业在经营管理中存在的薄弱环节和潜在风险，及时提出了改进管理和防范风险的建议。
此外，在全市“小金库”专项治理工作中，审计机关共发现14个单位设有45个“小金库”，涉及金额1468.92万元，发现有34个单位使用供货商提供的假发票824张，涉及金额1.12亿元。