琼州海峡是我国三大海峡之一，是连接海南岛与内陆地区的交通“咽喉”，也是全国最繁忙的水上运输大通道之一。据统计，海南省约90%以上的进出岛生产生活物资、30%左右的旅客及往来的所有车辆、火车都需要通过琼州海峡港口客滚运输进出岛。2018年，琼州海峡省际水路运输进出岛客流量1506万人次，进出岛车流量328万辆次。
长期以来，琼粤两省间的琼州海峡运输组织模式较为粗放，实行“大轮班”运营模式，滚动发班与定点发班同时执行。6家航运主体的49艘船舶根据到港顺序进行排班装载，千讯咨询发布的《中国港口市场前景调查分析报告》显示，成为琼州海峡港口通行效率低的主要原因之一。
广东湛江港徐闻港区南山作业区客滚码头投产前，维持现有码头格局不变，即海安港区、海安新港区、新海港区、秀英港区均参与运营。南山作业区客滚码头投产后，琼州海峡北岸运营码头以南山作业区为主、海安港区或海安新港区为辅，南岸运营码头以海口港新海港区为主、秀英港区为辅。
南山作业区客滚码头投产前，仍保持现有4条航线，分别为：海安港区往返新海港区航线、海安港区往返秀英港区航线、海安新港区往返新海港区航线、海安新港区往返秀英港区航线，排班占比均为25%。南山作业区客滚码头投产后，南山作业区往返新海港区航线暂按徐闻与海口间航班数量的60%排班，海安新港区或海安港区往返秀英港区航线暂按徐闻与海口间航班数量的40%排班，并视实际运营情况调整。