班期方案应当考虑淡季、旺季和超旺季情况进行排班。淡季按现有49艘船舶每日往返一次进行排班，同时增加海南方4个虚拟班航次；旺季按现有49艘船舶每两日往返三次进行排班，同时增加海南方每两日12个虚拟班航次；超旺季按现有49艘船舶每日往返两次进行排班。
由专家对各家企业的安全管理、经营和运输服务等情况，千讯咨询发布的《中国船市场前景调查分析报告》显示，以及每艘船舶的安全状况、服务质量等进行综合评价，并按照每艘船舶得分由高到低的顺序，由船舶所属企业依次在班期方案中一次性选择淡季、旺季和超旺季相应的往返班期，形成琼州海峡客滚运输班期表。
班期的制定应充分考虑客滚运输船舶的装卸效率，船舶开始装载至结束装载的时间不得超过1.5小时。如遇恶劣天气停航，珠江航务管理局海峡办和广东省、海南省海峡办要及时启动紧急疏运预案，待积压的车辆和旅客疏运完成后再恢复班轮化运营。琼州海峡联网售票服务信息系统上线试运营，为班轮化顺利实施奠定了基础。