长江经济带11省市拥有内河航运船舶超过10万艘，占全国船舶保有量的80%以上，船舶污染源主要有含油污水、垃圾、有毒化学品、柴油机排放的废气等。因船舶技术状况、污染源控制配套设施和管理等多方面因素，污染源未得到有效控制。
在顶层设计方面，应加强长江经济带建设的统一管理和宏观调控，兼顾水利、水电、航运、防洪、生态环境等协调发展。沿江省市要建立协调对话机制，共同研究长江黄金水道开发利用的重大问题和举措，实现协调互动发展。
目前，长航集团正在积极推进打造绿色环保船队、统筹绿色能源供应、建设船舶水上综合服务区等方面的工作。千讯咨询发布的《中国船市场前景调查分析报告》显示，持续加强江海直达系列船型、三峡升船机船型、多用途三峡标准船型、LNG运输船型研究，希望依靠现有水上加油站点，积极争取国家政策支持，推进上下游合作，构建LNG运输、水上加注和接收、水陆销售网络等供应体系，打造布局合理、覆盖齐全的LNG燃料供应链，保障长江船舶充足的LNG供给。
除了绿色发展外，在张锐看来，实现长江经济带高质量发展，加强综合运输体系建设意义重大。在长江物流大通道建设中，应以长江航运为主通道，配合发展其他运输方式，实现多种运输方式“无缝链接”。