莞惠城际装备的C2+ATO列车自动运行控制系统由中国通号自主研发，是中国通号为城际铁路量身打造的“高铁+地铁”列控系统，可实现最高时速200公里动车组自动驾驶、精准停车，实现公交化运行，并与国铁互联互通，满足城际铁路大流量、高密度运行需要，对未来的城际铁路建设具有重要意义。
信号系统是轨道交通的“大脑”，千讯咨询发布的《中国车市场前景调查分析报告》显示，车辆的发车、时速、到站等指令均由信号系统发出，是控制车辆安全、高效运行的指挥中枢。C2+ATO系统是中国通号在成熟的高铁CTCS-2级列控系统基础上，增加地铁列车自动驾驶功能（ATO）而自主研发的城际铁路信号系统。
莞惠城际分两段建设，其中惠州段已于2016年开通运营，运营时速最高可达200公里每小时，东莞段为东莞西站至常平东区间，共设7个车站。由中国通号旗下研究设计院集团负责全线通信、信号、信息和防灾系统集成，以及全套列控系统设备供货，上海工程局集团负责施工，凸显了中国通号设计研发、装备制造、工程服务“三位一体”的完整产业链优势，是中国通号整体品牌优势的又一次集中体现。
在中国通号列车自动运行控制系统保障下，列车不仅可以自动运行，而且具备车站定点停车功能，停车误差不超过两厘米；能实现运行自动调整，在到站后可以自行折返作业；车站站台设置的站台门与列车门可联动控制，将地铁特性移植到城际铁路，融合高铁的快速与地铁的便捷，有效适应城际铁路高速度、高密度、站间距短、公交化运营的特点，是中国通号为我国城际铁路运营“量身定做”的高端列车运行控制系统。
联调联试启动后，中国通号参建单位正进一步完善工作计划，做好联调联试期间各项工作，全力以赴确保联调联试的顺利进行，确保莞惠城际铁路年底全线通车目标如期实现。