《国务院关于依托黄金水道推动长江经济带发展的指导意见》指出，要提升南京、杭州、合肥都市区的国际化水平，同时将合肥与南京、杭州一同作为长三角的副城中心。
而合肥官方的解读认为，《意见》提到合肥16处，涉及具体项目多达14个，具体概括为：交通枢纽中心、副城中心、都市区、国家化水平和开发高地。尽管《意见》将合肥的地位提到了一个新高度，但不可否认的是，由于不靠近长江，合肥港口优势并不明显，同时，合肥港口（港口项目可行性研究报告）还面临严重的同质化竞争问题，这些都是合肥在抢抓长江经济带建设过程中面临的难题。
虽然将合肥与南京、杭州提升到同等地位，但是与南京、杭州相比，合肥仍存在不小差距。在经济规模上，合肥2013年GDP为4672.9亿元，分别相当于南京的58.3%、杭州的56%；而今年上半年合肥的GDP仅2154亿元，只相当于南京、杭州的一半。
此外，在《意见》中，也明确提出了建设合肥都市区的要求。对此，合肥的做法是推进合宁（合肥、南京）同城化，优化提升沪宁合主轴带功能，稳妥推进撤县并区，壮大城市规模。
合肥并不临靠长江，为此，合肥谋划建设江淮运河、合裕线高等级航道及支线航道网络，全面对接长江黄金水道，打造江淮流域合肥内河航运中心。
据合肥港航局提供的数据显示，合肥港去年吞吐量仅4600万吨，达到10.9万标箱。“虽然数字不大，但是进步很快，开港三年实现三级跳，发展势头很好，是全国内河航道增长势头较快的内河港口。”合肥港航局局长金平介绍，目前合肥航道深度是准二级航道，最好的合裕航道深度仅4米，“下一步我们的重点工作是提升合肥港的航运能力”。
受地理条件限制，合肥航道等级只能达到二级。“由于不靠近长江，我们的想法是利用合裕航道打造一个一级航道，把长江引进合肥，来实现合肥的通江达海，实现3000~5000吨船舶进入合肥港。”金平说。
“现在我们的船只能到上海的外高桥中转，因为我们的船都是内河港的船舶，未来打造一级航道，就可以直接通江达海。”合肥港航局分管规划建设的副局长尹鑫介绍，把合裕航道提升到一级航道，至少需要投入20亿元。
据了解，合肥市通江航道起点派河，通贯巢湖，经裕溪河入长江，航道全长约131公里，由派河、巢湖湖区、裕溪河三段航道以及巢湖和裕溪两座船闸枢纽组成，这也是合肥目前唯一的入江通道。
除此之外，合肥的第二条通江达海通道兆河-西河航道也有望年内开工，该航道位于合肥市庐江县、芜湖市无为县境内，全长约93公里，工程有望在2017年完工，整个整治工程预计投资40亿元。
尹鑫说：“第二目标就是江淮运河，打通江淮运河之后，合肥就成为江淮运河的枢纽港，就实现合肥的江淮航运中心，是长江与淮河的航运枢纽中心。”
在提升港口能力方面大步向前的合肥港，同样面临同质化竞争的难题。“安徽的港口目前内耗非常厉害，就是同质化竞争。”合肥港国际集装箱码头有限公司总经理姚永华说，“芜湖今年3月出台一个政策，一个集装箱从合肥拉到芜湖，过桥、过路费全免，还补助340元，这对合肥的冲击很大，特别是一些民营企业就会选择到芜湖出港。”
姚永华解释，按照规定，合肥有集装箱港口，就应该从合肥出港，这样可降低成本，也绿色环保，但是芜湖港这种政策就是抢了合肥的集装箱箱量。此外，马鞍山也出台了类似政策，都是在抢集装箱的箱量。
安徽省提出，要把马鞍山郑蒲港打造成安徽的 “北仑港”（位于宁波），足见对郑蒲港的重视，在姚永华看来，政府提出这一设想是对的，但这需要各个港口相互配合，避免出现无序化竞争。
在提出建设交通枢纽中心后不久，合肥就出台了具体的交通规划，根据规划，合肥将打造“米”字形铁路枢纽。具体为：东西向，重点建设合新六等5条铁路；南北向，重点建设合安九等2条铁路；东北至西南向，重点建设合长等2条铁路；西北至东南向，重点建设商合杭、合西等7条铁路。围绕枢纽扩能，重点建设高铁南站等6大工程。
规划还显示，合肥将打造四纵五横、两环多射高等级公路网；实施合肥新桥国际机场二期工程，增加国际航线，提高航班密度；启动建设庐江、肥东、长丰、巢湖等通用机场，争创通用航空运营试点。
为了避免港口的同质化竞争，合肥在全面应对长江经济带提出的培育世界级产业集群时，也进行产业的差异化发展。合肥提出打造四大产业集群，分别是信息技术、智能装备、生物医药、光伏新能源。“这四大产业集群都是合肥重点主打产业，也有不少龙头企业，港口的出货量也比较大，打造好这四大产业集群，有利于发展合肥港，避免同质化竞争。”合肥市发改委国民经济综合处处长范观兵说。