今年8月1日起，交通运输业和部分现代服务业“营改增”试点在全国范围内推开。据测算，全部试点地区2013年企业将减负1200亿元。
很对业内人士对于改革表示支持，认为减少了重复纳税问题，并有利于经济结构的调整。但是也有部分物流公司称，试点“营改增”后，由于税率陡升，规范纳税的中型物流企业税负反而增加了，其建议是否可以将人工成本列入进项税抵扣范围。另外，减少流通环节对物流公司来说也至关重要。
从去年1月1日起，上海正式启动交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点。下半年，北京、江苏、安徽、广东等11个省(市)也相继启动了“营改增”试点。改革的初衷是，“试点行业总体税负不增加或略有下降，基本消除重复征税。”
根据上海的实施细则，陆路、水运、航空（航空市场前景调查分析报告）等交通运输业适用11%的增值税税率，代替了过去营业税3%的税率;而仓储、配送和货运代理则采用6%的增值税税率，代替过去5%的营业税税率。来自财政部、国家税务总局的数据显示，2012年，试点“营改增”地区共为企业直接减税426.3亿元，整体减税面超过90%。
广东省物流行业协会副会长马仁洪称，大的物流企业因为业务种类多，涵盖公路、港口、铁路等运输方式，可抵扣的进行税也多，总体税负减少了。
国金证券此前预计，目前的税改方案或令多数交通运输企业税负加重。一是税率由3%提升至6%或11%;二是交通运输企业的主要成本中，固定成本和人工成本占比很高，但不能产生进项，可抵扣的项目比重太低。
兴业证券亦指出，物流辅助服务项目中包括一些人力成本占比很高的业务类型，如货物运输代理服务、代理报关服务、装卸搬运服务等。这些业务进项很少，而占成本大头的人力成本又不能抵扣进项，故税改对其受益有限。马仁洪预计，随着试点的扩大，物流公司面临的问题会越来越明显。“之前的利润率就不足4%，现在税率提高了8个百分点，很多公司利润几乎为零，甚至亏本经营。”
马仁洪建议，对纯运输型的物流企业，是否可以把人工成本列入抵扣进项，毕竟人力成本一般占到物流公司运营总费用的20%-30%。
为保障试点顺利进行，不少地区拿出财政资金，补贴税负增加较多的企业。据悉，上海去年就为月平均税负增加5000元以上的试点企业提供财政扶持资金约10亿元。广东省财政也安排了约10亿元试点专项资金。