维吾尔族传统纺织花毡有着悠久的传承史，但在现代工业化的影响下，各种原因造成了维吾尔族传统花毡不仅在适用范围上缩减，而且还在花色、技艺、图案上也有了不同程度的变化。随着人民生活水平的提高，花毡逐渐被各类毛纺织品所代替，其手工艺也面临失传的困境。如用腈纶线加工的地毯价格便宜、做工时间短、需要的劳动力少，并且不易被虫子咬坏、不易脱毛等优势慢慢占据了花毡在维吾尔族纺织品市场上的位置，导致花毡的消费人群减少。
千讯咨询发布的《中国纺织场前景调查分析报告》显示，纺织制毡是一项做工时间长、需要的劳动力多的技艺，但因为顾客少，导致工匠的收入微薄，很多毡匠都放弃了民间传统制毡技艺。由此，制毡艺人的数量锐减，师徒传承无法维系，鲜有人愿意学习该工艺，无人可传承的局面致使传统的制毡工艺面临消失。曾经有创业团队调查发现，许多少数民族年轻人表示不会做、不想做毛毡，不少人已对此失去兴趣。调查还发现，30岁以下的年轻人，已基本不会做花毡，仅知道这是本民族的一种重要日用物品，是一种文化及情感传承。
目前，维吾尔族传统花毡工艺存在的问题日益突出：一是加工机器效率低，传统的维吾尔族制毡技艺由纯手工制作，但耗时长，所需劳动力多，因此维吾尔族民间发明了一些加工机器，但囿于设备技术落后，所以效率往往低下。二是产品品种单一，传统制毡传承手段较为单一，致使花色品种均过于单一、创新滞后、赶不上时代的步伐。三是制毡艺人缺乏创新，生活在较偏僻乡村地区的制毡艺人几乎没有渠道认识、发现并理解现代工艺品市场的消费需求，无法对维吾尔族传统的花毡进行改造与创新。四是消费者少，花毡的品种单一、脱毛等缺点使维吾尔族的传统花毡无法在都市商业区域占领一席之地，导致消费人群仅限于乡村的维吾尔族消费者。