跨界河湖污染治理只是长三角需要携手推动的生态环境重要领域之一。此外，油品升级、船舶排放控制区建设、港口货运和集装箱转运专项治理、岸电推广应用等，也需要加大力度、积极探索。
据千讯咨询发布的《中国电市场前景调查分析报告》显示，使用绿色岸电能使靠港船舶减少高达95%的大气污染物排放。自2016年4月长三角率先启动船舶排放控制工作以来，截至2018年11月，长三角区域苏浙沪港口高压岸电设备共建成27套，但目前总体利用率仅为40%左右。港口绿色岸电推广工作遭遇瓶颈。
港口岸电技术在我国尚处于应用初期，从体制机制建设及应用效果来看，由于港口责任主体及利益主体众多，区域联动机制、投融资及运营模式、技术标准体系、考核监督体系等均存在不同程度的薄弱环节，其推进难度较大。只有尽快将这些领域的问题解决，我国港口岸电才能迎来发展的黄金期。
2018年，长三角区域生态环境协同保护又进入了新阶段，包括分阶段提前实施了船舶排放控制区措施，提前落实了国六油品升级，制定方案深化了重污染天气区域应急联动，联合制定实施了首个区域秋冬季大气污染综合治理攻坚行动方案，印发实施了太浦河水质预警联动方案等。
2019年，将以长三角一体化发展上升为国家战略为契机，深度开展长江生态治理与保护等区域生态环境联合研究，共同破解共性环境问题；同时探索推进区域标准统一，在目前实践基础上尽可能向高标准看齐；加强区域流动源联合监管，改善区域交通结构。