2017年1月是双方关系发生变化的重要转折点。当时，苹果向美国圣迭戈联邦法院提起诉讼，称高通利用市场支配地位滥征专利使用费，要求高通支付已承诺退还给苹果的10亿美元专利使用费。一直以来，高通都是按照整机售价5%的标准对设备制造商收取专利费。对此，苹果其实一开始就表示不满，因为这个模式下，随着手机ASP（平均销售价格）的提升，苹果需要支付的专利费也随之增长。但苹果认为，如果是与高通芯片专利无关的其他硬件成本增加，那高通的专利费则不应该随之提高。
随后经过谈判，双方在专利费上达成了一致，即苹果同意每台iPhone向高通支付7.5美元的专利费，同时，高通还会向苹果返还部分专利使用费。自2011年iPhone 4S使用高通芯片之后，双方的合作便一直延续直至2017年，据千讯咨询发布的《中国芯片市场前景调查分析报告》显示，高通为苹果提供了提升设备性能的芯片技术，而苹果则为高通带来了丰厚的专利收入。苹果之所以在2017年1月诉讼高通，导火索是高通决定收回对苹果的专利费优惠，这将直接导致苹果专利费支出的增加。而高通做出该决定，则是因为其认为苹果违背了双方当初的承诺。
在苹果提出诉讼三个月后，高通也对苹果提起反诉，除了否认苹果的指控外，高通还提出了苹果违反与高通的协议、干涉高通与被许可商之间的长期协议等罪状。双方的关系不断恶化。高通在全球多地以侵犯专利为由，申请对苹果产品的禁售。截至目前，中国福州中级人民法院、德国慕尼黑法院、美国加州南区联邦地方法院等均已认定苹果侵权。高通得到多国法院的支持，这对苹果而言，是一个非常不利的局面。
面对高通，苹果也不愿孤军奋战。苹果还拉来了富士康等盟友一起要求高通退还约90亿美元的款项。高通对此表示，在苹果推出iPhone产品之前，高通已与代工厂成功合作很多年，而苹果利用其在行业中的影响力，让代工厂违反与高通之间的长期合同，使高通损失了至少70亿美元的专利收入。