在金融行业发展中，金融科技的重要性正日益凸显。研究报告提到，深圳具有创新驱动的先发优势，香港具有金融服务的国际化和制度优势，这在粤港澳大湾区内形成了“科技+金融”的双轮驱动。粤港澳大湾区的金融融合要把金融科技作为一个非常重要的支撑点。深圳和香港聚集了非常多的金融科技企业，渗透率很高，完全有能力在金融科技方面走在全球前列。
据千讯咨询发布的的《中国金融市场前景调查分析报告》显示，从金融科技出发，应充分运用金融科技手段拓宽大湾区金融融合发展的可能性边界。具体建议包括：用好区块链的金融科技，助力大湾区民生金融和普惠金融发展；探索开展金融科技创新试验，实现在风险可控下更高效率、更快速度的金融创新和扩大开放；运用RegTech（监管科技），提升跨境金融服务监管效率；运用智能边界科技手段，大幅提升跨境人流物流通关的便利性。
事实上，2018年以来，粤港澳大湾区内已有多项金融科技应用陆续落地。2018年10月，香港微信钱包正式为香港用户提供内地移动支付服务；2019年3月起，港版支付宝用户在大湾区消费时可以通过线下扫码的方式进行跨境支付；同样是3月，深圳市公共交通领域实现金融IC卡·云闪付（NFC）应用全覆盖。
此外，2018年9月，中国人民银行深圳市中心支行与数字货币研究所联合金融机构搭建了“湾区贸易金融区块链平台”，企业可在平台上进行包括应收账款、贸易融资等多种场景的贸易和融资活动。目前湾区贸易金融区块链平台二期建设工作正在推动，上链包括跨境贸易、对外支付税务备案表、应收账款跨境融资、微票通等业务场景，未来还将与海关信息联通。
在金融科技之外，研究报告还从顶层设计、全局视角、激励机制、服务实体经济导向、金融市场、风险防范等维度，提出了未来粤港澳大湾区金融融合发展方向和多条政策建议。