住房制度顶层设计上，可以说深圳要颠覆1998年房改以来的架构。首先，土地供应从单一政府渠道向政府、企事业单位、村集体、棚户区、外围深莞惠等多元渠道转变；其次，住房供应由商品房为主，向政策性住房为主转变。其中，特别是主导供应的政策性住房，以市场房价的50%~60%、市场租金的50%配置，被认为是应对近十年房价“屡调屡涨”的真正长效机制。
深圳住房改革顶层设计的上述描述，在近两年国家及各地都有系统的部署，包括深圳2011年“十二五”、2105年“十三五”规划中，甚至，十八大重启改革议题以来，遵循“设计-规划-落地”，国家及各地也都有明确的措施。问题是，“一分部署、九分落实”，像住房这等系统性强、落地棘手的改革，从不缺顶层设计，缺的是配套制度的跟进、关键环节的攻坚克难、各职能部门协调而非推诿和扯皮。
千讯咨询发布的《中国土地市场前景调查分析报告》显示，土地供应确实要多渠道。事实上，2008年出台《深圳市城市更新办法》后，多渠道供地便已经开启了，但两个最重要的渠道，即以城中村为主的城市更新、工业区改造，现在看来其对住房问题的改善效果有限。供应新房90%的城市更新，尽管改善了城市面貌和功能，增加了单位空间的住房供应，但由于其要配建保障房、提供配套和公共空间，还要缴纳地价，再考虑到随房价高涨的拆迁成本，城市更新本质上产生了推高了房价的作用。
由于掌握用地的主体倾向开发商品房、政府规划调整不足、教育医疗等配套难落地等缘故，工业区转型最后出来的却是形形色色的“类住宅”，如商务公寓、公寓式办公、酒店式公寓、创新用房等，浪费了土地资源，“类住宅”等也驱动了投资炒作。现在，深圳任何一个角落，即便是毗邻低房价的莞惠，成本也已达到很高的水平。深圳此次房改要保护受高房价冲击的人群，但也是保护城市需要的优势产业人口。