目前，许多农民专业合作社都面临资金短缺的问题，这成为制约合作社发展的主要瓶颈。同时，发展过程中所呈现出的诸如合作社内部运行机制不健全、不能真正实行民主管理、不利于保护农民成员的合法权益等问题，严重制约或影响合作社发展，必须引起高度重视。为此，全国人大代表、山东省夏津县特教学校校长袁敬华建议：
一方面，应加强自身组织建设，充分挖掘和发挥合作社聚集人力、资金等资源的潜力，通过现有成员、潜在成员和其他机构、人员等多种渠道吸收更多的合作社入股资金。另一方面，要提升合作社自身的经济实力，符合商业银行发放贷款的抵押、质押的要求，以便获得商业银行贷款（创业贷款项目可行性研究报告）的支持。除此之外，应在合作社外部创造良好的环境，各大金融机构应该根据农业领域经营组织形式的转变，重点支持合作社的金融需求，制定专门的信贷政策，更好地扶持合作社的发展。与此同时，还应在地方政府各个相关部门之上成立一个协调领导小组来统一指导、扶持、服务、协调和监管合作社。这需要在法律中建立一个对合作社进行有效管理的体系。